根据2022年1月市委办公厅、市政府办公厅印发的《上海市交通委员会职能配置、内设机构和人员编制规定》（沪委办发〔2022〕4号），上海市交通委员会主要职责和内设机构如下：
上海市交通委员会主要职责
（一）贯彻执行有关交通运输工作的法律、法规、规章和方针、政策，研究起草有关交通运输工作的地方性法规、规章草案，拟订相关政策，并组织实施。
（二）拟订综合交通发展战略，优化交通运输结构布局，综合平衡全市交通运力，协调道路、水路、铁路和航空等多种交通运输方式衔接，促进多式联运发展，构建综合交通体系。负责指导各区交通运行组织，加强长江三角洲区域交通合作。统筹协调、组织推进“春运”、重大活动等交通保障工作。
（三）负责组织编制综合交通发展规划，轨道交通和地方铁路网络选线专项规划、交通配套设施专项规划，上海港口规划（含洋山深水港区），以及公路和城市道路、公共交通场站、岸线利用、航道等基础设施专项规划，并组织实施。负责指导审核各区交通中长期发展规划和交通专项规划。
（四）负责交通行业统计管理、经济运行监测和分析工作，组织开展综合交通调查和建设项目交通影响评价。拟订交通行业发展经济政策和调控措施，研究提出交通行业固定资产投资年度计划的建议，编制交通基础设施维护（养护）年度计划。组织协调市、区共同投资的交通基础设施项目建设，并监督实施。
（五）负责公路和城市道路、轨道交通和地方铁路、枢纽场站、公共交通站点、公共停车场（库）、港口、航道、桥梁、隧道等交通基础设施的项目建设管理、工程安全质量和文明施工管理。负责协调铁路、机场等基础设施项目与市内交通运输的衔接配套。负责轨道交通和地方铁路、高架道路和越江隧桥、港口、航道、机场等规划控制区域范围内新建、改建、扩建项目的审核。
（六）负责协调推进上海国际航运中心建设，加强现代航运服务体系建设。负责港口（含洋山深水港）岸线、陆域、水域的港政、航政管理，以及水上客货运输行业的监督管理。负责上海港引航的行政管理。组织实施地方海事和航道管理，负责船舶（含渔船）检验和监督管理，推进内河水上搜救体系建设。
（七）负责轨道交通和地方铁路运营、安全保护区作业的监督管理。负责组织指导交通运输综合行政执法工作。
（八）负责协调推进交通行业重大改革。负责交通行业成本规制、特许经营管理，参与制定交通行业的价格和收费标准，并组织实施。负责交通行业行政审批制度改革工作。牵头非营业性客车额度拍卖管理工作。按照有关规定，组织实施机动车额度管理工作。
（九）负责交通行业安全生产监督管理工作。组织协调交通运输安全应急工作，组织指导交通行业突发事件、灾害事故和服务供应事故的应急处置。
（十）负责推进交通行业科技进步、社会信用体系建设、数字化转型、信息化管理工作。负责交通行业环境保护、节能减排、污染防治的监督管理工作，组织开展交通专项规划的环境影响评价。拟订交通行业地方技术标准与规范，并组织实施。
（十一）负责国防交通工作，拟订交通战备建设规划，管理交通战备仓库。组织协调专项客货运输，以及有关国家重点物资、紧急和特种物资、军事和抢险救灾物资的交通运输工作。
（十二）负责协调铁路、民航、邮政、海事、救助、打捞等涉地管理工作。负责空港地区行政管理。组织开展交通行业国际交流与合作工作。
（十三）管理上海市道路运输管理局。
（十四）完成市委、市政府交办的其他任务。
上海市交通委员会内设机构
（一）办公室。
（二）研究室。
（三）组织人事处（老干部处）。
（四）计划财务处。
（五）法规处（行政审批制度改革处）。
（六）综合交通处。
（七）综合规划处。
（八）交通建设处。
（九）科技信息处。
（十）安全监督管理处。
（十一）航运处。
（十二）港务监督管理处（洋山港区管理办公室）。
（十三）轨道交通处。
（十四）铁路处。
（十五）交通战备处。
（十六）社会宣传处。
（十七）信访办公室。
（十八）审计处。